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干燥是微生物制品发酵的重要后处理环节，对于保证菌剂稳定性，后续贮存及运输具有重要意义。干燥通常需采用高温、真空、冷冻、辐射等方式进行，而这些干燥方式对枯草芽孢***生长环境而言均比较严峻。有研究对比了高温常压干燥(80°C)、冷冻干燥(真空度4Pa，温度35°C)和喷雾干燥(进风口温度180°C，出风口温度85°C)对芽孢***活菌数的影响。结果表明菌体在高温常压干燥过程中大量；喷雾干燥和冷冻干燥制剂的活菌数无明显差异；喷雾干燥和冷冻干燥过程中菌体损伤相近。

筛选出性能优良的菌株后，如何获得有效生物量更高的产品，是枯草芽孢***工业化生产中的核心问题。目前，应用于工业化的发酵工艺主要有以下3种：液态发酵、固态发酵和液固两相发酵。实际生产中，以液态发酵为主。

液态发酵是将活化接种到发酵罐中，进行液体培养的方法。其一般流程为接种，枯草芽孢***，发酵罐培养、过滤、浓缩、干燥从而得到菌剂。该方法的优点为液体环境有利于菌体、底物、产物以及热量的扩散，使得发酵在均质均热的条件下进行；发酵过程速度快，枯草芽孢***价格，周期短；便于监测和控制；易扩大培养规模。缺点为液体培养基的水分多，使得有价值的大分子物质浓度低，产生的废液也多；后续分离纯化困难，成本较高。

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